Для того, чтобы обеспечить совместимость WPGlobus и плагина Popups – WordPress Popup вы можете использовать следующий кусок кода

add_filter( 'spu/popup/content', 'wpglobus_popups_compatibility', 10, 2 );
function wpglobus_popups_compatibility( $content, $box ) {
  if ( class_exists('WPGlobus') ) {
    $content = WPGlobus_Core::text_filter( $content, WPGlobus::Config()->language );
  }
  return $content;
}

Просто поместите его в файл functions.php вашей темы.
UPDATE от 13.01.2016
Поддержка WPGlobus была добавлена в плагин Popups – WordPress Popup версии 1.4.4